申请ISO9001质量管理体系认证的组织可自主选择经认可的认证机构，不必考虑地区区分或行政业务的区分。任何人为强行指定认证机构的行为都是违法行为。选择认证中心时选取与其总部或在国家认监委备案的分支机构合作。

认证机构选定后，请求认证的企业就可以正式提出认证的请求，须提交一份正式的、由其授权代表签署的请求书，请求书及其附件一般包括：

1、请求认证的范围；

2、请求组织企业简介；

3、请求组织企业法人营业执照及资质文件；

4、企业产品实现流程图；

5、有关ISO9001质量管理体系及其活动的一般信息，怎么开始建立体系；6、质量手册、程序文件及其它有关文件清单；

7、从事工程类的企业还需提供项目清单及其具体的情况。